Roku 1384 kostel uváděn jako farní. Na konci 15. století sklenuto trojlodí, upravena sakristie.Během třicetileté války, v roce 1620, byl vypálen a následně znovu obnoven. Další opravy kostela byly provedeny v letech 1735-36, 1893 a 1940.
V období komunistického režimu byl využíván jako strážní stanoviště, nebyl však udržován a značně zchátral. Od roku 1995 organizovala římskokatolická církev rekonstrukci kostela, kterou finančně podpořilo Ministerstvo kultury ČR, rakouská vláda, vyhnaní němečtí rodáci z Cetvin a Jihočeský kraj. Hlavní práce na rekonstrukci exteriéru i interiéru byly dokončeny v roce 2003 a kostel byl dne 6.9.2003 slavnostně znovuvysvěcen.
Zcela zásadní hodnotu představuje jedinečná zachovaná pozdní gotická polychromie stěn a architektonických článků. Její základ tvoří bílá plocha stěn a kleneb, ozdobená nepravidelně rozmístěnými malovanými hvězdami, růžovými květy a stylizovanými rostlinami, vyrůstajícími ze středů kleneb a vrcholů klenebních oblouků.
Tuto základní plochu tektonicky člení, rytmizuje a rámuje iluzivní červeno-šedé kvádrování klenebních žeber, dveřních a okenních ostění i dalších architektonických prvků. Pozdně gotická výmalba kostela vznikla zřejmě v době kolem roku 1500.
Podle : Web obce Dolní Dvořiště
Petr PAVELEC, K stavební obnově a restaurování kostela Narození Panny Marie v Cetvinách